El Repositorio Académico Digital de la Universidad ORT Uruguay es un espacio para almacenar, organizar, preservar, dar libre acceso y visibilidad a nivel nacional e internacional de la producción científica, académica y cultural generada por los integrantes de la comunidad universitaria, en formato digital.
Recent Submissions
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CRISPR tools in bacterial whole-cell biocatalysis
(2023) Mulet, Ana Paula; Ripoll, Magdalena; Betancor, Lorena; Universidad ORT Uruguay; Universidad ORT Uruguay; Universidad ORT Uruguay
Biocatalysis has emerged as a promising alternative to conventional chemical processes for the production of a wide range of chemicals, providing a sustainable solution to the problem of limited resources due to an ever-increasing global population. This approach involves the use of biobased catalysts, such as whole microorganisms or enzymes, to perform chemical conversions. While whole-cell biocatalysts offer advantages over the use of free enzymes, limitations related to productivity and undesired compound production have been observed when using microorganisms. Offering high specificity, broad applicability, and increased efficiency over traditional genetic engineering methods, CRISPR-based technologies may be the quintessential tool for the fit-for-purpose design of efficient bacterial biocatalysts. In this work, we aim to demonstrate the potential of CRISPR-based technologies to enhance whole-cell bacterial biotransformations for a more sustainable obtention of industrially important products. We have included a comprehensive and in-depth analysis of the current state of the art, emphasizing challenges and opportunities for future research. Through a critical analysis of reported examples, we intend to highlight the opportunities and advantages offered by CRISPR-based technologies in the field of biocatalysis for more efficient, sustainable, and translational processes.
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New perspectives into Gluconobacter-catalysed biotransformations
(2023) Ripoll, Magdalena; Lerma Escalera, Jordy Alexis; Morones Ramírez, José Rubén; Rios Solis, Leonardo; Betancor, Lorena; Universidad ORT Uruguay; Universidad Autónoma de Nuevo León, México; Universidad Autónoma de Nuevo León, México; University of Edinburgh, United Kingdom; Universidad ORT Uruguay
Different from other aerobic microorganisms that oxidise carbon sources to water and carbon dioxide, Gluconobacter catalyses the incomplete oxidation of various substrates with regio- and stereoselectivity. This ability, as well as its capacity to release the resulting products into the reaction media, place Gluconobacter as a privileged member of a non-model microorganism class that may boost industrial biotechnology. Knowledge of new technologies applied to Gluconobacter has been piling up in recent years. Advancements in its genetic modification, application of immobilisation tools and careful designs of the transformations, have improved productivities and stabilities of Gluconobacter strains or enabled new bioconversions for the production of valuable marketable chemicals. In this work, the latest advancements applied to Gluconobacter-catalysed biotransformations are summarised with a special focus on recent available tools to improve them. From genetic and metabolic engineering to bioreactor design, the most recent works on the topic are analysed in depth to provide a comprehensive resource not only for scientists and technologists working on/with Gluconobacter, but for the general biotechnologist.
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Bacteria-polymer composite material for glycerol valorization
(2023) Ripoll, Magdalena; Soriano, Nicolás; Ibarburu, Sofía; Dalies, Malena; Mulet, Ana Paula; Betancor, Lorena; Universidad ORT Uruguay; Universidad ORT Uruguay; Universidad ORT Uruguay; Universidad ORT Uruguay; Universidad ORT Uruguay; Universidad ORT Uruguay
Bacterial immobilization is regarded as an enabling technology to improve the stability and reusability of biocatalysts. Natural polymers are often used as immobilization matrices but present certain drawbacks, such as biocatalyst leakage and loss of physical integrity upon utilization in bioprocesses. Herein, we prepared a hybrid polymeric matrix that included silica nanoparticles for the unprecedented immobilization of the industrially relevant Gluconobacter frateurii (Gfr). This biocatalyst can valorize glycerol, an abundant by-product of the biodiesel industry, into glyceric acid (GA) and dihydroxyacetone (DHA). Different concentrations of siliceous nanosized materials, such as biomimetic Si nanoparticles (SiNps) and montmorillonite (MT), were added to alginate. These hybrid materials were significantly more resistant by texture analysis and presented a more compact structure as seen by scanning electron microscopy. The preparation including 4% alginate with 4% SiNps proved to be the most resistant material, with a homogeneous distribution of the biocatalyst in the beads as seen by confocal microscopy using a fluorescent mutant of Gfr. It produced the highest amounts of GA and DHA and could be reused for up to eight consecutive 24 h reactions with no loss of physical integrity and negligible bacterial leakage. Overall, our results indicate a new approach to generating biocatalysts using hybrid biopolymer supports.
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SGS – Filiaciones
(Universidad ORT Uruguay, 2022) Ramírez Francia, Alejandra Martha; Ortega Alonso, Matías; Zito Nesta, Mauricio Alejandro; Ferreira Brancaccio, Viviana Soledad; Hernández Guimarans, Pablo; Rossa Hauck, Jean Carlo; Nieves Lema, Ruben Carlos
El siguiente proyecto presenta SGS - Filiaciones, una solución cuyo objetivo es el de facilitar el estudio de paternidad en especies animales realizadas en el laboratorio Genexa. Este laboratorio ha adquirido un equipo que permite serializar el ADN de una muestra biológica utilizando la tecnología SNP (polimorfismo de nucleótido único), generando archivos que tienen un gran volumen de datos y son extremadamente complejos para su manipulación y análisis. El laboratorio necesita tener la capacidad de extraer la información valiosa y necesaria de los archivos que dicho equipo genera, permitiendo realizar cálculos y búsquedas de información relevante. A través de esta solución, los técnicos podrán aprovechar al máximo el potencial de la nueva tecnología, pudiendo realizar un conjunto de pruebas simultáneas sin sufrir grandes retrasos al momento de procesar la información generada. El sistema aparte de agilizar el proceso de análisis de paternidad, almacenará dichos resultados en una base de datos, la cual se puede utilizar para futuras referencias, como por ejemplo, para la creación de un árbol genealógico o detección de marcadores de enfermedades en el genoma. Respecto a la tecnología, esta solución es de interfaz web desarrollada en tres capas principales, para la interfaz de usuario (“fronted”) se utiliza ReactJS, para el “backend” .NET Core con C[numeral] y la capa de datos es Microsoft SQL Server 2019. El servidor está alojado en Montevideo Hosting, y el versionado del código es en GitLab. Como resultado del proyecto, se obtuvo un producto funcional con gran potencial de crecimiento.
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En búsqueda de la armonía
(Universidad ORT Uruguay, 2023) Klinger, Joseline; Laufer, Iair; di Perna, Paula; Acosta, Héctor
El objetivo de esta memoria es rastrear la evolución histórica del concepto de armonía, abarcando desde el Renacimiento hasta la actualidad, destacando momentos históricos clave. Esto sentará las bases para explorar si la neurociencia aplicada a la arquitectura podría brindar una comprensión más profunda de la armonía en la experiencia humana contemporánea. Para ello el trabajo se estructura en capítulos que proponen una contextualización de los problemas de la arquitectura en la contemporaneidad desde una mirada crítica, luego desarrollan los planteos sobre el concepto de armonía en momentos clave de la historia de la arquitectura para culminar con la introducción al concepto de neuroarquitectura como un nuevo paradigma de lo armónico desde el entendido del cerebro humano como un órgano sensorial. Los autores consideran a la neuroarquitectura como el resultado final de un proceso que inicia en la primeras décadas del siglo XX y que ha tenido como exponentes principales a Richard Neutra, Louis Khan y Juhani Pallasmaa.